Para poder diseñar productos multimedia educativos, es necesario conocer cómo se procesa la información en la mente humana.
Es recomendable profundizar en el Aprendizaje Multimedia, el diseño de la Instrucción Multimedia, la Codificación Dual, la Teoría de la Carga Cognitiva de Sweller y la Teoría Cognitiva del Aprendizaje Multimedia de Richard Mayer.

Dentro de la metodología de trabajo de las aplicaciones multimedia educativas, debe considerarse una etapa de Planeación Instruccional, donde se organicen y relacionen los objetivos del contenido educativo, las características del usuario (estudiante), la manera en que se le presentará la información y la forma como interacturá con este material.
También es importante incluir una etapa de Planeación Cognitiva en la que se analice la aplicación de los diversos principios del aprendizaje multimedia al contenido educativo, con el objetivo de reducir o evitar la sobrecarga cognitiva.

A pesar de estas consideraciones, existe un factor que desafía la planeación y el diseño de este tipo de aplicaciones: la respuesta del usuario, que comprende, por un lado, el tipo de información (input) que el sistema acepta (a través del mouse, teclado,etc.) y por el otro, las decisiones que el sujeto toma ante la información y las opciones de interacción.